Thiếu biển chỉ dẫn, nguồn nhân lực mỏng, môi trường chưa sạch, và đặc biệt là quy hoạch xây dựng thiếu đồng bộ là những vấn đề nổi cộm trong phát triển du lịch tại tỉnh Bắc Kạn nói chung và danh thắng Hồ Ba Bể nói riêng.